Центр коллективного пользования
(ЦКП)
«Биоинформатика»
Программа СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика»
Научный совет СО РАН по биоинформатике

ЦКП "Биоинформатика" (Суперкомпьютерный кластер и вычислительные задачи)
ЦКП "Биоинформатика" («Геномика.Протеомика.Биоинформатика»)
ЦКП "Биоинформатика" (краткая официальная информация)

ЦКП «Биоинформатика» является организационной структурой, направленной на консолидацию организационных, вычислительных, и финансовых ресурсов учредителей для решения задач и подготовки специалистов в области компьютерной биологии и биоинформатики на основе высокопроизводительных вычислений

Научные секции ЦКП

  1. Компьютерная геномика и транскриптомика (к.б.н. Ю.Л. Орлов)
  2. Компьютерная протеомика (к.б.н. В.А. Иванисенко)
  3. Многомерный анализ биологических данных (д.б.н. В.М. Ефимов)
  4. Математическое моделирование молекулярно-генетических систем и процессов (д.б.н. В.А. Лихошвай)
  5. Эволюционная биоинформатика (к.б.н. Д.А. Афонников)
  6. Популяционно-генетический и сегрегационный анализ (д.б.н. Т.И. Аксенович)
  7. Моделирование макромолекул методами молекулярной динамики (д.ф.-м.н. Ю.Н. Воробьев, к.б.н. Э.С.Фомин)
  8. Анализ биологических текстов (text-mining) (к.б.н. В.А. Иванисенко)
  9. Организация работ на вычислительном кластере (д.т.н. Б.М. Глинский)
  10. Математические проблемы биоинформатики (чл.-корр. РАН, д.ф.-м.н. С.С.Гончаров, к.б.н. Е.Е.Витяев)

Цели

 Целью совместных усилий Организаций-Учредителей при создании ЦКП «Биоинформатика» является создание сетевой, вычислительной и программно-информационной инфраструктуры, объединяющей в единый технологический комплекс высокопроизводительные экспериментальные установки с высокопроизводительными вычислительными комплексами и хранилищами данных через специализированные высокоскоростные сети передачи данных, а также биоинформационная поддержка научно-исследовательских работ с использованием высокопроизводительных вычислений и современных высокопроизводительных экспериментальных технологий, создание совместных исследовательских групп, подготовка специалистов в области компьютерной системной биологии и биоинформатики, разработка новых экспериментально-теоретических технологий системной биологии и получения на этой основе новых фундаментальных знаний и научных результатов мирового уровня.





Организации-Учредители
  1. Институт цитологии и генетики СО РАН, (ИЦиГ СО РАН, г. Новосибирск)
  2. Институт вычислительной математики и математической геофизики СО РАН, (ИВМиМГ СО РАН, г. Новосибирск)
  3. «Международный томографический центр» СО РАН (ИМТЦ СО РАН, г. Новосибирск)
  4. Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН (ИХБФМ СО РАН, г. Новосибирск)
  5. Институт математики СО РАН (ИМ СО РАН, г. Новосибирск)
  6. Институт вычислительных технологий СО РАН (ИВТ СО РАН, г. Новосибирск)
  7. ГОУ ВПО «Новосибирский государственный университет» (НГУ, г.Новосибирск)

Основными направлениями совместной деятельности Организаций учредителей, осуществляемой в рамках ЦКП «Биоинформатика», являются:
  1. Биоинформационная поддержка научно-исследовательских работ с использованием высокопроизводительных вычислений и современных высокопроизводительных экспериментальных технологий;
  2. Разработка методов хранения биологических данных;
  3. Разработка алгоритмов обработки биологических данных;
  4. Исследования в области высокопроизводительных и распределенных вычислений в биоинформатике;
  5. Компьютерное моделирование живых систем;
  6. Подготовка специалистов в области высокопроизводительных вычислений в биоинформатике.

Кластер ИЦиГ СО РАН закуплен в рамках Программы СО РАН «Геномика, протеомика, биоинформатика», целями которой являются:
Базовые организации программы

Данный интернет-ресурс разработан при поддержке РФФИ, грант 11-04-01888 (Компьютерное исследование молекулярных механизмов регуляции транскрипции с помощью высокопроизводительного секвенирования ДНК и иммунопреципитации хроматина (ChIP-seq) в геноме раковых клеток)

Контактная информация: 630090, Новосибирск, пр. Ак. Лаврентьева, 10, ИЦиГ СО РАН
Телефон: Тел.: +7(383) 333-34-68. Факс: +7(383) 333-12-78
Email: bioinformatics@bionet.nsc.ru
Интернет-адрес: ЦКП "БИОИНФОРМАТИКА" http://bioinformatics.bionet.nsc.ru/